Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调控高效率全景图

京都大学的科学研究医务人员和RIKEN Research科学研究室的共同者们仍然设立了首个针对自身自体性病症和自身瘙痒性病症的突变信息库。想要这一天然资源能为自体病症的发展提供新的见解，并意味著有助于药品的推测。化学家们还想要，与自体特别的突变组信息图集最终意味著用到诸如COVID-19等疾病的科学研究。

京都大学项目科学研究助理，医学风湿病学家，新功能突变组学专家Mineto Ota指导教授话说：“要认识病症，就需深刻理解突变个体差异的新功能。有了这个信息集，我们就可以将与病症特别的DNA基因序列个体差异的信息与对病症发病系统极其举足轻重的突变和巨噬细胞各种类型联系起来。”Ota是该一个小组发表在《Cell》杂志上的评论的主要笔记，评论标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的化学家们共同展开的。

笔记写道，自体内源性的病症（IMD）之外从自身自体性到自身瘙痒的多种解剖。他们指显露，尽管IMD之中炎性巨噬细胞因子的异常活动表明自体巨噬细胞新功能暴发了个体差异，但是，“对于IMD的特别突变甚至特别巨噬细胞各种类型知之甚少。”

均突变组关联性科学研究（GWAS）推测了许多与IMD特别的突变组亚基。但是，在此类关联性科学研究之中鉴定显露的许多突变个体差异都位处调控突变“on”或“off”强调的DNA非序列区域内，而不是位处突变序列基因序列之中。科学研究一个小组指显露：“GWAS仍然揭示了许多与精细表现型和病症特别的突变组亚基，之外IMD。这些个体差异之中的大多数都位处非序列突变组区域内，偏爱是基因表达积体电路，如增强子和启动子。”

为了揭示基因表达DNA的新功能，一种不尽相同各种类型的突变组数据分析，称为强调定量表现型突变亚基（eQTL），用以将DNA基因序列的关联与突变强调的关联联系起来。利用eQTL信息，科学研究医务人员可以对基因表达DNA基因序列的目的、基因表达基因序列之中的个体差异如何影响其基因表达突变的强调以及这些突变强调关联如何导致病症这两项不够明智的臆测。

其它针对自体的eQTL科学研究仍然在展开之中，但原本的科学研究工作只之外心理健康数以千计，并核对了局限数量的巨噬细胞各种类型。科学研究医务人员写道：“对心理健康NAD自体巨噬细胞的科学研究意味著未能能猎捕病症精神状态下推测的一系列eQTL现像。此外，虽然对自体巨噬细胞的实验性性刺激可以在无论如何上模拟病症精神状态，但相当却是反映显露体内的心理环境。”

Ota多余道：“瘙痒精神状态下，自体巨噬细胞的宇宙学特性与心理健康精神状态下的相同巨噬细胞截然不尽相同。与自体情况下特别的突变个体差异意味著只在染病精神状态下起作用，因此对于这种各种类型的突变科学研究，从确实病患身上换取比对极其举足轻重。”

在他们最新刊文的科学研究之中，科学研究一个小组对79名心理健康数以千计和337名被诊断身患10种不尽相同各种类型自体内源性病症（之外类风湿性关节炎、系统性疾患和系统性硬化症）的病患展开了均突变组基因组。所有数以千计都是日本帝国血缘关系。

认识自体内源性的病症具趣味性，因为尽管每种病症在医学上都是不尽相同的，但仍有许多重合之处，并且具相同诊断的病患意味著会表现显露极其不尽相同的呕吐。科学研究医务人员多余话说：“由于所有这些多样性，一次进修一种自体内源性病症的能力是局限的。但是，如果我们一起科学研究10种病症，就可以不够均面地认识这些各种类型的病症。”

在完成均突变组基因组后，科学研究医务人员从数以千计的尿液比对之中分离显露28种不尽相同各种类型的自体特别巨噬细胞，并测量了这些巨噬细胞之中的突变强调。“我们在图集之中看到，每种自体巨噬细胞各种类型都有不尽相同的eQTL结果，这可以告诉我们巨噬细胞各种类型之间突变基因表达的关联，以及哪种巨噬细胞各种类型对于发展哪种病症至关举足轻重。”科学研究医务人员话说。

笔记分析报告话说，“在突变强调数据分析之中，我们在一个该平台上对多个IMD展开尤其，使我们都能描述每个病症（病患）的特征，并识别与单个病症抗原特别的突变，以及在一组IMD之中失调的通路……我们的信息集使我们都能样品每个特定巨噬细胞各种类型之中eQTL现像的心理（病症）文化背景驱动的干扰。”

科学研究医务人员将得到的天然资源名称为京都大学自体巨噬细胞突变强调图集（ImmuNexUT），并话说它代表了适用东亚血缘关系数以千计设立的最大的eQTL信息集。他们总结道：“我们确定了自体巨噬细胞各种类型抗原的eQTL现像，之外实际上未能刊文的常见巨噬细胞各种类型，它们在心理瘙痒条件下的多样性，以及这些eQTL与IMD表现型之间的很大关联性。”

“到此前，在这一各个领域，大规模的突变组和新功能突变组科学研究主要是利用欧洲地区人口为120人展开的，尽管社会阶层多样性对于精准理解突变组新功能至关举足轻重。”科学研究医务人员话说，“这个日本帝国受试者的eQTL图集对于克服这种以欧洲地区为之中心的偏见，融合欧洲地区的信息集进一步科学研究DNA个体差异的新功能，也具举足轻重本质。”

科学研究医务人员想要ImmuNexUT信息库将之后放缓，并最终为病患带来不够好的结果。他们话说：“与之前刊文的天然资源相比，我们的信息集具契合而利于的特征，之外均面的自体巨噬细胞分作、人口为120人之间自体情况下的个体差异以及同质的非欧洲地区人口为120人。”